Naczelną władzą Towarzystwa jest Walne Zebranie.
Zarząd i Komisja Rewizyjna stanowią władze wykonawcze.
Prezes: dr inż Andrzej Fórmaniak
Wiceprezes ds. Nauk Humanistycznych i Społecznych: dr Andrzej Suchcitz
Wiceprezes ds. Nauk Matematyczno-Przyrodnicznych, Medycznych i Technologicznych: dr inż Andrzej Fórmaniak
Sekretarz Generalny: dr Marek Laskiewicz
Skarbnik: mgr Jadwiga Kowalska
Sekretarz ds. Członkowskich: dr Marek Laskiewicz
Redaktor Rocznika Towarzystwa i referent prasowy: Krzysztof Rowiński
Komisja Rewizyjna
Przewodniczący: mgr Rafael Gallera
Członkowie: dr Wojciech Rappak, Małgorzata Staszczak-Goddard