Naczelną władzą Towarzystwa jest Walne Zebranie.
Zarząd i Komisja Rewizyjna stanowią władze wykonawcze.
Prezes: dr hab. Andrzej Suchcitz
Wiceprezes ds. Nauk Humanistycznych i Społecznych: vacat
Wiceprezes ds. Nauk Matematyczno-Przyrodnicznych, Medycznych i Technologicznych: dr inż. Marian Zastawny
Sekretarz Generalny: dr Marek Laskiewicz
Skarbnik: dr Wojciech Rappak
Redaktor Rocznika Towarzystwa: Krzysztof Rowiński
Członek: mgr Jadwiga Kowalska
Sekretarz ds. Członkowskich: dr Marek Laskiewicz
Komisja Rewizyjna
Przewodniczący: inż. Wojciech Tobiasiewicz
Członkowie: mgr Rafael Gallera, Małgorzata Staszczak-Goddard